消灭蔑尔乞部是铁木真统一蒙古的最后一战。蔑尔乞部分布于今贝加尔湖西南岸、色楞格河及鄂尔浑河下游。铁木真父亲也速该死后,他遭受重大挫折。铁木真正准备积蓄力量时,遭到蔑尔乞人的袭击,连妻子也成了蔑尔乞人的俘虏。后来,铁木真夺回妻子,联合脱斡里勒汗和札木合打败蔑尔乞人,迫使蔑尔乞人向色楞河方向逃去,大批蔑尔乞人成了他的俘虏。1204年,铁木真征服乃蛮部后,威名震动了蒙古高原,余下的尚未征服的部落,或被击败,或自动归附。当年秋,铁木真消灭了他的宿敌蔑尔乞残部,大败蔑尔乞首领脱脱,俘获了他的百姓,脱脱带着他的两个儿子和几个朋友逃走了。不久,翁吉剌残部、汪古部也归附了铁木真。这时,只剩下十分潦倒的札木合。由于大势所趋,札木合的部下知道败局已经无法挽回,便把札木合捆绑了交给铁木真,最后被铁木真处死。至此,铁木真统一全蒙古的大业完成了。