玉泉寺在石门山腰，始建于金泰和年间(1201-1208年)，原名全真观，是峄山道教的下院。明永乐年间(1403-1424年)扩建时，道教势力衰微，佛教兴盛，因观中有“玉泉”，遂更名玉泉寺，也习称石门寺。寺内有楼、堂、殿、阁数间，主体建筑千佛殿飞檐斗拱，气势恢宏，至今保存完好，千佛殿后有禅堂，是诸僧参禅清修之地，寺院西南有钟楼。玉泉寺规模虽不大，但石门山景色极佳，因此自曲阜城中来此游览者甚众，清代著名剧作家孔尚任更终老于此。

孔尚任，清代文学家，孔子64代孙，山东曲阜人。康熙十七年(1678年)秋孔尚任登石门山，爱山色之美，顿萌隐居之志，遂于胜涵峰阴叠茅筑庐，至今峰下尚有遗迹。康熙二十一年被衍圣公孔毓圻聘请出山，先为衍圣公夫人治丧，后修《阙里志》及《孔氏家谱》，二十三年为康熙皇帝讲经，破格授国子监博士，三十九年罢官，四十一年春重归石门山，潜心读书，创作了名剧《桃花扇》，并写了大量赞美石门山的诗文，其中一首描述他雨中游石门山、玉泉寺所见到的景致：

山尾山头拖翠长，吟鞭摇雨路苍苍。

不成村舍三家住，稍有田塍半断荒。

铺地云容如海市，遮天峰势似边墙。

溪回岭转无穷态，直到门前见夕阳。

《冒雨过石门山，后由横岭口转寺前》诗紧扣诗题，用写实的手法，描绘行路中所见雨中山景，峰回路转，到玉泉寺门前时，却已雨过天晴，红红的夕阳给石门山、玉泉寺披上了万道霞光，景色十分迷人。清代颜光猷也有《石门》诗：

石门山寺白云深，乱雨飞花野火侵。

法帐空悬莲叶散，梵钟不响草虫吟。

牛羊历落千林满，藤挂苍凉一径阴。

草阁昔年何处是，流泉仿佛似鸣禽。

诗以苍凉的笔调述说着山寺颓态已露，盛时远逝的故事，山色青翠依旧，流泉淙淙作响，不禁流露出一点淡淡的物是人非的悲凉。